{"id":4218,"date":"2021-03-08T10:43:27","date_gmt":"2021-03-08T10:43:27","guid":{"rendered":"https:\/\/cobcm.net\/blogcobcm\/?p=4218"},"modified":"2021-03-09T19:12:58","modified_gmt":"2021-03-09T19:12:58","slug":"interacciones-proteinas-aplicacion","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/cobcm.net\/blogcobcm\/2021\/03\/08\/interacciones-proteinas-aplicacion\/","title":{"rendered":"M\u00e9todos para estudiar interacciones entre prote\u00ednas y su posible aplicaci\u00f3n al estudio de las mol\u00e9culas reguladas por CCR7 en las c\u00e9lulas dendr\u00edticas"},"content":{"rendered":"\n

Las prote\u00ednas son las mol\u00e9culas encargadas de ejecutar las funciones celulares, y, para realizar esto de forma coordinada, deben interactuar entre s\u00ed estableciendo interacciones prote\u00edna-prote\u00edna (IPPs) para constituir complejos moleculares con nuevas propiedades funcionales. De acuerdo con esto, es coherente que entorno al 80% de las prote\u00ednas interact\u00faen entre s\u00ed para desempe\u00f1ar funciones como la regulaci\u00f3n g\u00e9nica o la se\u00f1alizaci\u00f3n celular. Adem\u00e1s, estas interacciones son de car\u00e1cter din\u00e1mico y responden a est\u00edmulos tanto intracelulares como extracelulares.<\/p>\n\n\n\n

Las interacciones prote\u00edna-prote\u00edna (IPPs) constituyen una de las 3 redes que conforman el interactoma<\/strong>, conjunto de interacciones entre componentes celulares, junto a las redes metab\u00f3licas<\/a> que regulan todas las reacciones qu\u00edmicas y metab\u00f3licas que ocurren en la c\u00e9lula, y las redes de regulaci\u00f3n g\u00e9nica, implicadas en el control de expresi\u00f3n g\u00e9nica.<\/p>\n\n\n\n

\"prote\u00ednas\"
Redes que conforman el interactoma. El interactoma est\u00e1 formado por redes de IPPs, redes metab\u00f3licas (prote\u00edna-metabolito) y redes de regulaci\u00f3n g\u00e9nica (prote\u00edna-ADN y prote\u00edna-ARN).<\/figcaption><\/figure><\/div>\n\n\n\n

El gran reto de las prote\u00ednas<\/h4>\n\n\n\n

Conocer con gran precisi\u00f3n este interactoma es uno de los retos m\u00e1s importantes en biolog\u00eda desde la secuenciaci\u00f3n del genoma humano en el 2003. La importancia de adquirir un mapa completo y preciso del interactoma reside en que nos permitir\u00eda comprender con mayor detalle las bases moleculares de la enfermedad humana (ya que se ha observado que en la mayor\u00eda de las enfermedades humanas el interactoma parece estar alterado) y as\u00ed poder desarrollar nuevas estrategias terap\u00e9uticas dirigidas a las interacciones que se vean afectadas, consiguiendo as\u00ed una medicina personalizada.<\/p>\n\n\n\n

Para la identificaci\u00f3n y caracterizaci\u00f3n de estas IPPs se han desarrollado una amplia variedad de tecnolog\u00edas en los \u00faltimos 20 a\u00f1os, cada una de ellas con sus ventajas y limitaciones, de modo que debemos conocer con gran detalle qu\u00e9 tipo de interacci\u00f3n queremos detectar, as\u00ed como su naturaleza y el tipo celular. Los m\u00e9todos para detectar interacciones prote\u00edna-prote\u00edna podemos dividirlos en m\u00e9todos binarios y m\u00e9todos co-complejos. Los primeros tienen como objetivo detectar parejas de prote\u00ednas que interact\u00faan mientras que los m\u00e9todos co-complejos grandes complejos proteicos.<\/p>\n\n\n\n

Funci\u00f3n intracelular<\/h4>\n\n\n\n

Estas t\u00e9cnicas pueden emplearse para detectar todo tipo de interacciones entre prote\u00ednas, pero son especialmente \u00fatiles en las v\u00edas de se\u00f1alizaci\u00f3n intracelular, donde el n\u00famero de prote\u00ednas que interact\u00faan es enorme. Un ejemplo de aplicaci\u00f3n es la prote\u00edna CCR7, un receptor de quimioquinas presente en c\u00e9lulas dendr\u00edticas que regula diversas funciones agrupadas en 4 m\u00f3dulos de se\u00f1alizaci\u00f3n (supervivencia, apoptosis, quimiotaxis y din\u00e1mica de actina) con un alto grado de independencia entre ellos.<\/p>\n\n\n\n

\"prote\u00ednas\"
M\u00f3dulos reguladores usados por CCR7 para regular la supervivencia, la apoptosis, la quimiotaxis y la regulaci\u00f3n de la actina en las c\u00e9lulas dendr\u00edticas. Todas las interacciones han sido tanto detectadas experimentalmente como predichas por STRING.<\/figcaption><\/figure><\/div>\n\n\n\n

Mediante t\u00e9cnicas experimentales empleando inhibidores, en los \u00faltimos 10 a\u00f1os en el grupo de Jose Luis Rodr\u00edguez Fern\u00e1nde<\/a>z se han ido identificando las prote\u00ednas que conforman estos m\u00f3dulos, as\u00ed como las interacciones entre ellas. Empleando el programa inform\u00e1tico STRING se realiz\u00f3 una predicci\u00f3n de las interacciones de cada una de las prote\u00ednas pertenecientes a los m\u00f3dulos regulados por CCR7, obteniendo as\u00ed un interactoma de cada una de ellas.<\/p>\n\n\n\n

\"\"
Interactoma de la prote\u00edna RhoA (rojo), perteneciente al m\u00f3dulo de regulaci\u00f3n de la din\u00e1mica de actina.<\/figcaption><\/figure><\/div>\n\n\n\n

Adem\u00e1s de analizar el interactoma individual de cada prote\u00edna, se llev\u00f3 a cabo un an\u00e1lisis del interactoma global de CCR7, incluyendo as\u00ed tanto interacciones que se producen dentro de un m\u00f3dulo como aquellas que se establecen entre m\u00f3dulos diferentes. Todo este estudio con STRING nos ha permitido confirmar las interacciones que ya hab\u00edan sido detectadas experimentalmente, as\u00ed como descubrir nuevas interacciones que pueden ser analizadas en futuros estudios.<\/p>\n\n\n\n

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Autor: \u00c1lvaro G\u00f3mez Mor\u00f3n.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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